Innerdeutsche Flüge an den Bodensee gehen fast immer nach Friedrichshafen (Deutschland), aber manchmal auch in die Nähe: nach Memmingen im Allgäu oder nach Zürich, obwohl die Stadt in der Schweiz ebenfalls nicht am Bodensee liegt. Es ist also auch möglich, nonstop Linienflüge mit Swiss, Lufthansa oder Air Berlin in Richtung Bodensee günstig online zu buchen.

Friedrichshafen besitzt einen kleinen aber feinen Flughafen. Der S-Bahn Anschluss ins Zentrum ist gut: die Fahrt bis zum Hauptbahnhof Friedrichshafen dauert nur wenige Minuten. Friedrichshafen (FDH) kann man sogar per nonstop Flug günstig erreichen, etwa mit Germanwings (ab Köln Bonn), InterSky (ab Berlin, Hamburg, Düsseldorf).

Um einen innerdeutschen Billigflug nach Friedrichshafen (z.B. mit InterSky oder Germanwings) zu bekommen, wird ein frühzeitiger Flug Preisvergleich im Internet empfohlen. Denn Billigflug Angebote sind besonders für Frühbucher erhältlich, auch nach Friedrichshafen am Bodensee.